학교자율감사는 학교 자체적으로 감사반을 편성하여 감사 시기, 방법 등을 계획한 후 학사업무 전반에 대하여 자율적으로 감사를 실행하고 그 결과에 대한 처분, 개선하는 방법으로 운영한다.

2016년에 4개 학교를 시범 운영하였고 2017년부터 학교의 신청으로 매년 3~4개 학교에서 학교자율감사를 실시하고 있다. 도교육청에서는 학교자율감사 운영 매뉴얼을 마련하여 지원하고 있다.

도교육청 관계자는“학교자율감사 실시로 학교 경영의 신뢰성, 투명성, 책무성을 제고하고, 자율적 통제 기능 강화와 자정 노력을 통해 책임경영 하는 교육풍토를 조성하고자 한다.”라고 전했다.